Protus institutioner
Det praktiska arbetet sker i Protus avdelningar, utskot och arbetsgrupper, som omfattar mer än 100 aktiva volontärer.
Verksamhetsledaren (toiminnanjohtaja@protu.fi) ansvarar för beredningen av styrelsens beslut samt föreningens ekonomiska och operativa verksamhet som helhet, inklusive ledning av avdelningssverksamheten.
Beslutande institutioner
Föreningsstämman
Föreningsstämman bestående av medlemmar har den högsta makten i föreningen. Enligt reglerna har Protu minst två bolagsstämmor varje år: ett vårmöte och ett höstmöte. Vid behov kan även en extra bolagsstämma anordnas. Föreningsstämma sammankallas av föreningens styrelse.
Styrelsen
Protus styrelse leder han föreningens verksamhet under sin mandatperiod och beslutar om de allmänna riktlinjerna. Styrelsen ansvarar för genomförandet av den verksamhetsplan, strategi och dokument som styrelsen själv utarbetar. Styrelsen har från och med 2025 en ordförande och 6 ledamöter. Styrelsen utses på höstmötet.
Styrelsen 2025: Alma Koivisto (ordförande), Juho Ärmänen (1. vice ordförande), Ara Majamäki (2. vice ordförande), Mira Ahjoniemi, Eleonoora Helenius, Maija Iilikainen ja Viima Veteläinen.